Ero sivun ”Ghemicalin peruskäyttö” versioiden välillä
Siirry navigaatioon
Siirry hakuun
ei muokkausyhteenvetoa
p (oppaat-luokkaan päädyttiin nyt irkissä) |
Ei muokkausyhteenvetoa |
||
| Rivi 1: | Rivi 1: | ||
''Ghemical on vaativaan käyttöön soveltuva kemiallisten molekyylien mallinnusohjelma. Ohjelma toimii hyvin myös peruskäytössä, esimerkiksi orgaanisen kemian molekyylien piirtämiseen ja esittämiseen kolmiulotteisesti. Ghemicalin avulla molekyylien rakennetta on mahdollista esitellä ja opiskella | ''Ghemical on vaativaan käyttöön soveltuva kemiallisten molekyylien mallinnusohjelma. Ohjelma toimii hyvin myös peruskäytössä, esimerkiksi orgaanisen kemian molekyylien piirtämiseen ja esittämiseen kolmiulotteisesti. Ghemicalin avulla molekyylien rakennetta on mahdollista esitellä ja opiskella havainnollisesti.'' | ||
== Mitä tämä artikkeli käsittelee? == | == Mitä tämä artikkeli käsittelee? == | ||
| Rivi 8: | Rivi 8: | ||
[[Image:2-Ghemical-kayttoliittyma.png]] | |||
# '''Työkalurivi''' - Ohjelman päätyökalut | # '''Työkalurivi''' - Ohjelman päätyökalut | ||
| Rivi 19: | Rivi 20: | ||
Työkalurivin toiminnot ovat seuraavat. | Työkalurivin toiminnot ovat seuraavat. | ||
[[Image:]] | [[Image:3-Ghemical-tyokalurivi.png]] | ||
# '''Draw''' - Piirtotyökalu jolla haluttuja alkuaine atomeita voidaan lisätä napsauttamalla mallinnusaluetta sekä lisätä niiden välisiä sidoksia | # '''Draw''' - Piirtotyökalu jolla haluttuja alkuaine atomeita voidaan lisätä napsauttamalla mallinnusaluetta sekä lisätä niiden välisiä sidoksia | ||
| Rivi 47: | Rivi 48: | ||
* Valitse lisättäväksi alkuaineeksi '''hiili''' (C) | * Valitse lisättäväksi alkuaineeksi '''hiili''' (C) | ||
[[Image:]] | [[Image:4-Ghemical-alkuainetaulukko.png]] | ||
* Valitse '''Draw'''-työkalu | * Valitse '''Draw'''-työkalu | ||
* Napsauta '''mallinnusaluetta''' hiiren ykkspainikkeella. Tällöin atomi lisätään alueelle. | * Napsauta '''mallinnusaluetta''' hiiren ykkspainikkeella. Tällöin atomi lisätään alueelle. | ||
[[Image:]] | [[Image:5-Ghemical-atomin lisays.png]] | ||
* Lisää samalla tavalla vielä kaksi atomia yhteen riviin | * Lisää samalla tavalla vielä kaksi atomia yhteen riviin | ||
[[Image:]] | [[Image:6-Ghemical-atomin lisays2.png]] | ||
Hiilien lisäämisen jälkeen lisätään niiden väliset yksinkertaiset sidokset. | Hiilien lisäämisen jälkeen lisätään niiden väliset yksinkertaiset sidokset. | ||
| Rivi 63: | Rivi 64: | ||
* Valitse sidoksen tyypiksi yksinkertainen (single) | * Valitse sidoksen tyypiksi yksinkertainen (single) | ||
[[Image:]] | [[Image:7-Ghemical-sidoksen tyyppi.png]] | ||
* Varmista että '''Draw'''-työkalu on valittuna | * Varmista että '''Draw'''-työkalu on valittuna | ||
* Siirrä hiiri ensimmäisen hiilen päälle, paina hiiren ykköspainike pohjaan ja vedä sidos viereiseen hiilen pitämällä painiketta pohjassa | * Siirrä hiiri ensimmäisen hiilen päälle, paina hiiren ykköspainike pohjaan ja vedä sidos viereiseen hiilen pitämällä painiketta pohjassa | ||
[[Image:]] | [[Image:8-Ghemical-sidoksen piirtaminen.png]] | ||
* Toista tämä toisen ja kolmannen hiilen kanssa | * Toista tämä toisen ja kolmannen hiilen kanssa | ||
[[Image:]]Nyt hiilirunko on valmis. | [[Image:9-Ghemical-sidoksen piirtaminen2.png]]Nyt hiilirunko on valmis. | ||
=== Vetyjen lisääminen === | === Vetyjen lisääminen === | ||
| Rivi 84: | Rivi 85: | ||
* Valitse avautuvasta valikosta '''Build''' > '''Hydrogens''' > '''Add''' | * Valitse avautuvasta valikosta '''Build''' > '''Hydrogens''' > '''Add''' | ||
[[Image:]] | [[Image:10-Ghemical-vetyjen lisays.png]] | ||
Tällöin Ghemical lisää automaattisesti oikean määrän vetyatomeja hiilien ympärille. | Tällöin Ghemical lisää automaattisesti oikean määrän vetyatomeja hiilien ympärille. | ||
[[Image:]] | [[Image:11-Ghemical-vetyjen lisays2.png]] | ||
Napsauttamalla hiiliatomeja uudelleen '''Select'''-työkalulla saadaan atomien valinta poistettua ja väri takaisin harmaaksi. | Napsauttamalla hiiliatomeja uudelleen '''Select'''-työkalulla saadaan atomien valinta poistettua ja väri takaisin harmaaksi. | ||
| Rivi 97: | Rivi 98: | ||
* Napsauta mallinnusalueella hiiren kakkospainiketta | * Napsauta mallinnusalueella hiiren kakkospainiketta | ||
* Valitse avautuneesta valikosta '''Compute''' > '''Geometry optimization...''' | * Valitse avautuneesta valikosta '''Compute''' > '''Geometry optimization...''' | ||
== Molekyylimallin pyörittäminen == | == Molekyylimallin pyörittäminen == | ||