Ghemicalin peruskäyttö - Muutoshistoria

Lahtis: siirto luokkaan

2020-04-01T13:01:13Z

siirto luokkaan

← Vanhempi versio		Versio 1. huhtikuuta 2020 kello 16.01
Rivi 110:		Rivi 110:

	[[Luokka:Ohjeet]]		[[Luokka:Ohjeet]]
	[[Luokka:~~Tiedeohjelmat~~]]		[[Luokka:Kemianohjelmat]]

OpinsysASokero: ohjelinkin lisäys

2009-09-08T11:58:18Z

ohjelinkin lisäys

← Vanhempi versio		Versio 8. syyskuuta 2009 kello 14.58
Rivi 2:		Rivi 2:

	Tässä oppaassa tutustutaan Ghemical-ohjelmiston perustoimintoihin sekä tutustutaan yksinkertaisen esimerkin avulla molekyylin mallintamiseen. Peruskäyttäjän ei välttämättä tarvitse olla tietoinen ohjelman kaikista ominaisuuksista. Ghemical on tällä hetkellä saatavilla vain englanninkielisenä ja sen käyttöliittymä saattaa näyttää erilaiselta ohjelman eri versioiden välillä.		Tässä oppaassa tutustutaan Ghemical-ohjelmiston perustoimintoihin sekä tutustutaan yksinkertaisen esimerkin avulla molekyylin mallintamiseen. Peruskäyttäjän ei välttämättä tarvitse olla tietoinen ohjelman kaikista ominaisuuksista. Ghemical on tällä hetkellä saatavilla vain englanninkielisenä ja sen käyttöliittymä saattaa näyttää erilaiselta ohjelman eri versioiden välillä.

			Ohjelman muihin ominaisuuksiin voi tutustua [[Ghemicalin lisätoimintoja]] -ohjeen avulla

	== Ohjelman toiminnot ==		== Ohjelman toiminnot ==

Pb: olisiko enemmänkin tiede- kuin opetusohjelma

2009-07-31T13:33:13Z

olisiko enemmänkin tiede- kuin opetusohjelma

← Vanhempi versio		Versio 31. heinäkuuta 2009 kello 16.33
Rivi 107:		Rivi 107:
	*[[Avogadro]]		*[[Avogadro]]

			[[Luokka:Ohjeet]]
	[[Luokka: ~~Oppaat~~]]		[[Luokka:Tiedeohjelmat]]
	[[Luokka: ~~Opetusohjelmat~~]]

Heikki: siirsi sivun Ghemical: perusohje uudelle nimelle Ghemicalin peruskäyttö: Paremmalle nimelle

2009-07-30T22:15:42Z

siirsi sivun Ghemical: perusohje uudelle nimelle Ghemicalin peruskäyttö: Paremmalle nimelle

← Vanhempi versio	Versio 31. heinäkuuta 2009 kello 01.15
(ei mitään eroa)

Pb: johdanto

2009-07-30T18:56:47Z

johdanto

← Vanhempi versio		Versio 30. heinäkuuta 2009 kello 21.56
Rivi 1:		Rivi 1:
	''[[Ghemical]] on vaativaan käyttöön soveltuva kemiallisten molekyylien mallinnusohjelma. Ohjelma toimii hyvin myös peruskäytössä, esimerkiksi orgaanisen kemian molekyylien ~~piirtämiseen~~ ja ~~esittämiseen~~ kolmiulotteisesti. Ghemicalin avulla molekyylien rakennetta on mahdollista esitellä ja opiskella havainnollisesti.''		[[Ghemical]] on vaativaan käyttöön soveltuva kemiallisten molekyylien mallinnusohjelma. Ohjelma toimii hyvin myös peruskäytössä, esimerkiksi orgaanisen kemian molekyylien piirtämisessä ja esittämisessä kolmiulotteisesti. Ghemicalin avulla molekyylien rakennetta on mahdollista esitellä ja opiskella havainnollisesti.

	~~== Mitä tämä artikkeli käsittelee? ==~~		Tässä oppaassa tutustutaan Ghemical-ohjelmiston perustoimintoihin sekä tutustutaan yksinkertaisen esimerkin avulla molekyylin mallintamiseen. Peruskäyttäjän ei välttämättä tarvitse olla tietoinen ohjelman kaikista ominaisuuksista. Ghemical on tällä hetkellä saatavilla vain englanninkielisenä ja sen käyttöliittymä saattaa näyttää erilaiselta ohjelman eri versioiden välillä.
	Tässä oppaassa tutustutaan Ghemical-ohjelmiston perustoimintoihin sekä tutustutaan yksinkertaisen esimerkin avulla molekyylin mallintamiseen. ~~Ghemical on vaativaan käyttöön soveltuva ohjelmisto jonka kaikista ominaisuuksista peruskäyttäjän~~ ei ~~välttämttä~~ tarvitse olla tietoinen. ~~Ohjelma~~ on tällä hetkellä saatavilla vain ~~englannin kielisenä~~ ja sen käyttöliittymä saattaa näyttää erilaiselta ohjelman eri versioiden välillä.

	== Ohjelman toiminnot ==		== Ohjelman toiminnot ==

Heikki: /* Hiilirungon tekeminen */ rivinvaihto

2009-07-30T14:15:50Z

Hiilirungon tekeminen: rivinvaihto

← Vanhempi versio		Versio 30. heinäkuuta 2009 kello 17.15
Rivi 71:		Rivi 71:
	* Toista tämä toisen ja kolmannen hiilen kanssa		* Toista tämä toisen ja kolmannen hiilen kanssa

	[[Image:9-Ghemical-sidoksen piirtaminen2.png]]Nyt hiilirunko on valmis.		[[Image:9-Ghemical-sidoksen piirtaminen2.png]]

			Nyt hiilirunko on valmis.

	=== Vetyjen lisääminen ===		=== Vetyjen lisääminen ===

Heikki: wikilinkki, katso myös

2009-07-30T14:01:36Z

wikilinkki, katso myös

← Vanhempi versio		Versio 30. heinäkuuta 2009 kello 17.01
Rivi 1:		Rivi 1:
	''Ghemical on vaativaan käyttöön soveltuva kemiallisten molekyylien mallinnusohjelma. Ohjelma toimii hyvin myös peruskäytössä, esimerkiksi orgaanisen kemian molekyylien piirtämiseen ja esittämiseen kolmiulotteisesti. Ghemicalin avulla molekyylien rakennetta on mahdollista esitellä ja opiskella havainnollisesti.''		''[[Ghemical]] on vaativaan käyttöön soveltuva kemiallisten molekyylien mallinnusohjelma. Ohjelma toimii hyvin myös peruskäytössä, esimerkiksi orgaanisen kemian molekyylien piirtämiseen ja esittämiseen kolmiulotteisesti. Ghemicalin avulla molekyylien rakennetta on mahdollista esitellä ja opiskella havainnollisesti.''

	== Mitä tämä artikkeli käsittelee? ==		== Mitä tämä artikkeli käsittelee? ==
Rivi 102:		Rivi 102:

	Näin molekyyliä voidaan vapaasti pyörittää haluttuun katselukulmaan.		Näin molekyyliä voidaan vapaasti pyörittää haluttuun katselukulmaan.

			== Katso myös ==
			*[[Avogadro]]


	[[Luokka: Oppaat]]		[[Luokka: Oppaat]]
	[[Luokka: Opetusohjelmat]]		[[Luokka: Opetusohjelmat]]

Heikki: kh, kursivointi eikä lihavointi, typokorjaus, viilailua

2009-07-30T14:00:07Z

kh, kursivointi eikä lihavointi, typokorjaus, viilailua

OpinsysASokero (30. heinäkuuta 2009 kello 13.08)

2009-07-30T13:08:03Z

← Vanhempi versio		Versio 30. heinäkuuta 2009 kello 16.08
Rivi 1:		Rivi 1:
	''Ghemical on vaativaan käyttöön soveltuva kemiallisten molekyylien mallinnusohjelma. Ohjelma toimii hyvin myös peruskäytössä, esimerkiksi orgaanisen kemian molekyylien piirtämiseen ja esittämiseen kolmiulotteisesti. Ghemicalin avulla molekyylien rakennetta on mahdollista esitellä ja opiskella ~~hyvin~~ havainnollisesti.''		''Ghemical on vaativaan käyttöön soveltuva kemiallisten molekyylien mallinnusohjelma. Ohjelma toimii hyvin myös peruskäytössä, esimerkiksi orgaanisen kemian molekyylien piirtämiseen ja esittämiseen kolmiulotteisesti. Ghemicalin avulla molekyylien rakennetta on mahdollista esitellä ja opiskella havainnollisesti.''

	== Mitä tämä artikkeli käsittelee? ==		== Mitä tämä artikkeli käsittelee? ==
Rivi 8:		Rivi 8:


			[[Image:2-Ghemical-kayttoliittyma.png]]

	# '''Työkalurivi''' - Ohjelman päätyökalut		# '''Työkalurivi''' - Ohjelman päätyökalut
Rivi 19:		Rivi 20:
	Työkalurivin toiminnot ovat seuraavat.		Työkalurivin toiminnot ovat seuraavat.

	[[Image:]]		[[Image:3-Ghemical-tyokalurivi.png]]

	# '''Draw''' - Piirtotyökalu jolla haluttuja alkuaine atomeita voidaan lisätä napsauttamalla mallinnusaluetta sekä lisätä niiden välisiä sidoksia		# '''Draw''' - Piirtotyökalu jolla haluttuja alkuaine atomeita voidaan lisätä napsauttamalla mallinnusaluetta sekä lisätä niiden välisiä sidoksia
Rivi 47:		Rivi 48:
	* Valitse lisättäväksi alkuaineeksi '''hiili''' (C)		* Valitse lisättäväksi alkuaineeksi '''hiili''' (C)

	[[Image:]]		[[Image:4-Ghemical-alkuainetaulukko.png]]

	* Valitse '''Draw'''-työkalu		* Valitse '''Draw'''-työkalu
	* Napsauta '''mallinnusaluetta''' hiiren ykkspainikkeella. Tällöin atomi lisätään alueelle.		* Napsauta '''mallinnusaluetta''' hiiren ykkspainikkeella. Tällöin atomi lisätään alueelle.

	[[Image:]]		[[Image:5-Ghemical-atomin lisays.png]]

	* Lisää samalla tavalla vielä kaksi atomia yhteen riviin		* Lisää samalla tavalla vielä kaksi atomia yhteen riviin

	[[Image:]]		[[Image:6-Ghemical-atomin lisays2.png]]

	Hiilien lisäämisen jälkeen lisätään niiden väliset yksinkertaiset sidokset.		Hiilien lisäämisen jälkeen lisätään niiden väliset yksinkertaiset sidokset.
Rivi 63:		Rivi 64:
	* Valitse sidoksen tyypiksi yksinkertainen (single)		* Valitse sidoksen tyypiksi yksinkertainen (single)

	[[Image:]]		[[Image:7-Ghemical-sidoksen tyyppi.png]]

	* Varmista että '''Draw'''-työkalu on valittuna		* Varmista että '''Draw'''-työkalu on valittuna
	* Siirrä hiiri ensimmäisen hiilen päälle, paina hiiren ykköspainike pohjaan ja vedä sidos viereiseen hiilen pitämällä painiketta pohjassa		* Siirrä hiiri ensimmäisen hiilen päälle, paina hiiren ykköspainike pohjaan ja vedä sidos viereiseen hiilen pitämällä painiketta pohjassa

	[[Image:]]		[[Image:8-Ghemical-sidoksen piirtaminen.png]]

	* Toista tämä toisen ja kolmannen hiilen kanssa		* Toista tämä toisen ja kolmannen hiilen kanssa

	[[Image:]]Nyt hiilirunko on valmis.		[[Image:9-Ghemical-sidoksen piirtaminen2.png]]Nyt hiilirunko on valmis.

	=== Vetyjen lisääminen ===		=== Vetyjen lisääminen ===
Rivi 84:		Rivi 85:
	* Valitse avautuvasta valikosta '''Build''' > '''Hydrogens''' > '''Add'''		* Valitse avautuvasta valikosta '''Build''' > '''Hydrogens''' > '''Add'''

	[[Image:]]		[[Image:10-Ghemical-vetyjen lisays.png]]

	Tällöin Ghemical lisää automaattisesti oikean määrän vetyatomeja hiilien ympärille.		Tällöin Ghemical lisää automaattisesti oikean määrän vetyatomeja hiilien ympärille.

	[[Image:]]		[[Image:11-Ghemical-vetyjen lisays2.png]]

	Napsauttamalla hiiliatomeja uudelleen '''Select'''-työkalulla saadaan atomien valinta poistettua ja väri takaisin harmaaksi.		Napsauttamalla hiiliatomeja uudelleen '''Select'''-työkalulla saadaan atomien valinta poistettua ja väri takaisin harmaaksi.
Rivi 97:		Rivi 98:
	* Napsauta mallinnusalueella hiiren kakkospainiketta		* Napsauta mallinnusalueella hiiren kakkospainiketta
	* Valitse avautuneesta valikosta '''Compute''' > '''Geometry optimization...'''		* Valitse avautuneesta valikosta '''Compute''' > '''Geometry optimization...'''

	~~[[Image:]]~~

	== Molekyylimallin pyörittäminen ==		== Molekyylimallin pyörittäminen ==

Heikki: oppaat-luokkaan päädyttiin nyt irkissä

2009-07-30T12:42:25Z

oppaat-luokkaan päädyttiin nyt irkissä

← Vanhempi versio		Versio 30. heinäkuuta 2009 kello 15.42
Rivi 109:		Rivi 109:


	[[Luokka: ~~Käyttöoppaat~~]]		[[Luokka: Oppaat]]
	[[Luokka: Opetusohjelmat]]		[[Luokka: Opetusohjelmat]]

← Vanhempi versio		Versio 30. heinäkuuta 2009 kello 17.00
Rivi 6:		Rivi 6:
	== Ohjelman toiminnot ==		== Ohjelman toiminnot ==
	Ghemicalin perusikkuna näyttää perustilassa seuraavalta.		Ghemicalin perusikkuna näyttää perustilassa seuraavalta.


	[[Image:2-Ghemical-kayttoliittyma.png]]		[[Image:2-Ghemical-kayttoliittyma.png]]

			Käyttöliittymä koostuu seuraavista osista:
	# '''Työkalurivi''' - Ohjelman päätyökalut		# '''Työkalurivi''' - Ohjelman päätyökalut
	# '''Välilehdet'''		# '''Välilehdet'''
	# '''Mallinnustila''' - Kolmiulotteinen alue jossa molekyylit esitetään ja mallinnetaan		# '''Mallinnustila''' - Kolmiulotteinen alue, jossa molekyylit esitetään ja mallinnetaan
	# '''Ohjelman tulosteet '''- Viestit joita ohjelma tulostaa toimintoihin liittyen		# '''Ohjelman tulosteet '''- Viestit joita ohjelma tulostaa toimintoihin liittyen

	Lisää ohjelman toimintoja on saatavissa napsauttamalla mallinnustilaa hiiren oikealla napilla~~. Tällöin avautuu seuraavanlainen valikko~~. Valikon jokaista toimintoa ei tulla käymään tässä oppaassa läpi.		Lisää ohjelman toimintoja on saatavissa napsauttamalla mallinnustilaa hiiren oikealla napilla. Valikon jokaista toimintoa ei tulla käymään tässä oppaassa läpi.

	=== Työkalurivi ===		=== Työkalurivi ===
Rivi 22:		Rivi 22:
	[[Image:3-Ghemical-tyokalurivi.png]]		[[Image:3-Ghemical-tyokalurivi.png]]

	# '''Draw''' - Piirtotyökalu jolla haluttuja ~~alkuaine~~ atomeita voidaan lisätä napsauttamalla mallinnusaluetta ~~sekä lisätä niiden välisiä sidoksia~~		# ''Draw'' - Piirtotyökalu jolla haluttuja atomeita ja niiden välisiä sidoksia voidaan lisätä napsauttamalla mallinnusaluetta
	# '''Erase -''' Pyyhekumityökalu jolla voidaan poistaa yksittäisiä atomeita niitä napsauttamalla		# ''Erase'' - Pyyhekumityökalu jolla voidaan poistaa yksittäisiä atomeita niitä napsauttamalla
	# '''Select''' - Valintatyökalu jolla voidaan valita haluttuja atomeja aktiiviseksi niitä napsauttamalla		# ''Select'' - Valintatyökalu jolla voidaan valita haluttuja atomeja aktiiviseksi niitä napsauttamalla
	# '''Zoom '''- ~~Zoomaus työkalu~~ joka toimii pitämällä mallinnusalueella hiiren ykköspainiketta pohjassa ja liikuttamalla hiirtä eteen-taaksesuunnassa		# ''Zoom ''- Zoomaustyökalu joka toimii pitämällä mallinnusalueella hiiren ykköspainiketta pohjassa ja liikuttamalla hiirtä eteen-taaksesuunnassa
	# '''Trans XY''' - Liikuta mallinnusaluetta XY-suunnassa		# ''Trans XY'' - Liikuta mallinnusaluetta XY-suunnassa
	# '''Trans Z''' - Liikuta mallinnusaluetta Z-suunnassa (muistuttaa ~~Zoomia~~)		# ''Trans Z'' - Liikuta mallinnusaluetta Z-suunnassa (muistuttaa zoomia)
	# '''Orbit XY''' - Kierrä mallinnusaluetta XY-suunnassa		# ''Orbit XY'' - Kierrä mallinnusaluetta XY-suunnassa
	# '''Orbit Z''' - Kierrä mallinnusaluetta Z-suunnassa		# ''Orbit Z'' - Kierrä mallinnusaluetta Z-suunnassa
	# '''Rotate XY''' - Pyöritä mallinnusaluetta XY-suunnassa		# ''Rotate XY'' - Pyöritä mallinnusaluetta XY-suunnassa
	# '''Rotate Z''' - Pyöritä mallinnusaluetta Z-suunnassa		# ''Rotate Z'' - Pyöritä mallinnusaluetta Z-suunnassa
	# '''Measure''' - Mittaa atomien välisiä etäisyyksiä napsauttamalla haluttuja atomeja		# ''Measure'' - Mittaa atomien välisiä etäisyyksiä napsauttamalla haluttuja atomeja
	# '''Element''' - Valitse (Draw-työkalulla) piirrettävä atomi jaksollisesta järjestelmästä		# ''Element'' - Valitse (''Draw''-työkalulla) piirrettävä atomi jaksollisesta järjestelmästä
	# '''Bond type '''- Valitse atomien välisen sidoksen tyyppi		# ''Bond type''- Valitse atomien välisen sidoksen tyyppi
	# '''Setup''' - Asetuksia		# ''Setup'' - Asetuksia



	== Molekyylin mallintaminen ==		== Molekyylin mallintaminen ==
	Seuraavassa mallinnetaan ~~propaani-molekyyli~~ joka on yksikertainen, suoraketjuinen alkaanihiilivety. ~~Propani~~ koostuu kolmesta ~~hiiliatomista~~ ja kahdeksasta ~~vetymolekyylistä~~.~~ ~~ Seuraavia vaiheita voidaan hyvin soveltaa erilaisten hiilivetyjen tekemiseen.		Seuraavassa mallinnetaan propaanimolekyyli, joka on yksikertainen, suoraketjuinen alkaanihiilivety. Propaani koostuu kolmesta hiil- ja kahdeksasta vetyatomista. Seuraavia vaiheita voidaan hyvin soveltaa erilaisten hiilivetyjen tekemiseen.

	=== Hiilirungon tekeminen ===		=== Hiilirungon tekeminen ===
	Ensimmäisenä propaanista tehdään sen kolmihiilinen runko. Tämä tapahtuu pääasiallisesti '''Draw'''- ja ''~~'element'~~''-työkaluja käyttäen.		Ensimmäisenä propaanista tehdään sen kolmihiilinen runko. Tämä tapahtuu pääasiallisesti ''Draw''- ja ''Element''-työkaluja käyttäen.
			* Napsauta ''Element''-työkalua
	* Napsauta '''Element'''-työkalua		* Valitse lisättäväksi alkuaineeksi ''hiili'' (C)
	* Valitse lisättäväksi alkuaineeksi '''hiili''' (C)

	[[Image:4-Ghemical-alkuainetaulukko.png]]		[[Image:4-Ghemical-alkuainetaulukko.png]]

	* Valitse '''Draw'''-työkalu		* Valitse ''Draw''-työkalu
	* Napsauta '''mallinnusaluetta''' hiiren ~~ykkspainikkeella~~. Tällöin atomi lisätään alueelle.		* Napsauta ''mallinnusaluetta'' hiiren ykköspainikkeella. Tällöin atomi lisätään alueelle.

	[[Image:5-Ghemical-atomin lisays.png]]		[[Image:5-Ghemical-atomin lisays.png]]
Rivi 59:		Rivi 58:
	[[Image:6-Ghemical-atomin lisays2.png]]		[[Image:6-Ghemical-atomin lisays2.png]]

	Hiilien lisäämisen jälkeen lisätään niiden väliset yksinkertaiset sidokset.		Hiilien lisäämisen jälkeen lisätään niiden väliset yksinkertaiset sidokset:
			* Valitse ''Bond type''
	* Valitse '''Bond type'''		* Valitse sidoksen tyypiksi yksinkertainen (''single'')
	* Valitse sidoksen tyypiksi yksinkertainen (single)

	[[Image:7-Ghemical-sidoksen tyyppi.png]]		[[Image:7-Ghemical-sidoksen tyyppi.png]]

	* Varmista että '''Draw'''-työkalu on valittuna		* Varmista että ''Draw''-työkalu on valittuna
	* Siirrä hiiri ensimmäisen hiilen päälle, paina hiiren ykköspainike pohjaan ja vedä sidos viereiseen hiilen pitämällä painiketta pohjassa		* Siirrä hiiri ensimmäisen hiilen päälle, paina hiiren ykköspainike pohjaan ja vedä sidos viereiseen hiilen pitämällä painiketta pohjassa

Rivi 80:		Rivi 78:
	Ghemical tarjoaa kuitenkin myös helpomman tavan vetyjen lisäämiseen, joka tapahtuu seuraavasti.		Ghemical tarjoaa kuitenkin myös helpomman tavan vetyjen lisäämiseen, joka tapahtuu seuraavasti.

	* Valitse '''Select'''-työkalu		* Valitse ''Select''-työkalu
	* Napsauta yksitellen jokaista ~~hiili atomia~~ niin että ne muuttavat värinsä vaalean punaisiksi		* Napsauta yksitellen jokaista hiiliatomia niin, että ne muuttavat värinsä vaalean punaisiksi
	* Napsauta mallinnusalueella hiiren kakkospainiketta		* Napsauta mallinnusalueella hiiren kakkospainiketta
	* Valitse avautuvasta valikosta '''Build''' > '''Hydrogens''' > '''Add'''		* Valitse avautuvasta valikosta ''Build'' -> ''Hydrogens'' -> ''Add''

	[[Image:10-Ghemical-vetyjen lisays.png]]		[[Image:10-Ghemical-vetyjen lisays.png]]
Rivi 89:		Rivi 87:
	Tällöin Ghemical lisää automaattisesti oikean määrän vetyatomeja hiilien ympärille.		Tällöin Ghemical lisää automaattisesti oikean määrän vetyatomeja hiilien ympärille.

	[[Image:11-Ghemical-vetyjen lisays2.png]]~~ ~~		[[Image:11-Ghemical-vetyjen lisays2.png]]

	Napsauttamalla hiiliatomeja uudelleen '''Select'''-työkalulla saadaan atomien valinta poistettua ja väri takaisin harmaaksi.		Napsauttamalla hiiliatomeja uudelleen ''Select'''työkalulla saadaan atomien valinta poistettua ja väri takaisin harmaaksi.

	=== Molekyylin rakenteen optimointi ===		=== Molekyylin rakenteen optimointi ===
	Piirrettäessä molekyylejä vapaalla kädellä atomien etäisyydet ja niiden väliset kulmat eivät tule oikein. Piirtämisen jälkeen rakenne voidaan automaattisesti optimoida seuraavasti.		Piirrettäessä molekyylejä vapaalla kädellä atomien etäisyydet ja niiden väliset kulmat eivät tule oikein. Piirtämisen jälkeen rakenne voidaan automaattisesti optimoida seuraavasti:

	* Napsauta mallinnusalueella hiiren kakkospainiketta		* Napsauta mallinnusalueella hiiren kakkospainiketta
	* Valitse avautuneesta valikosta '''Compute''' > '''Geometry optimization...'''		* Valitse avautuneesta valikosta ''Compute'' -> ''Geometry optimization...''

	== Molekyylimallin pyörittäminen ==		== Molekyylimallin pyörittäminen ==
	Molekyyliä voidaan vapaasti pyörittää kolmiulotteisessa avaruudessa työkalurivin toimintojen avulla. Helpoin työkalu tähän on '''Orbit XY'''-toiminto~~. ~~		Molekyyliä voidaan vapaasti pyörittää kolmiulotteisessa avaruudessa työkalurivin toimintojen avulla. Helpoin työkalu tähän on ''Orbit XY' '-toiminto:
			* Valitse ''Orbit XY''
	* Valitse '''Orbit XY'''
	* Paina hiiren keskipainike pohjaan ja liikuta hiirtä		* Paina hiiren keskipainike pohjaan ja liikuta hiirtä